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科技部傑出技術移轉貢獻獎.：

依據「科技部補助學術研發成果管理與推廣作業要點(104.6.5修正)」，本校承接自科技部委託及補助計畫所獲得歸屬於國科會或本校之成果，經本中心完成技轉簽約且權益收入總額超過新台幣100萬元者，得依個案向科技部申請此獎項。每案至多核給新台幣15萬元獎勵金，及每位研究人員獎牌一面。

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農委會智財權保護運用獎勵金：

依據「行政院農業委員會科學技術研究發展成果管理及運用獎助作業要點(106.10.26修正)」，本校承接自農委會委託及補助計畫所獲得歸屬於本校之成果，經本中心申請取得發明專利權、植物新品種權、畜禽新品種或新品系者，得向農委會申請此獎勵金，每案核給新台幣2萬元。

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農委會技術移轉菁英獎：

依據「行政院農業委員會科學技術研究發展成果管理及運用獎助作業要點(106.10.26修正)」，本校承接自農委會委託及補助計畫所獲得歸屬於本校之成果，經本中心完成技轉簽約且權益收入總額超過新台幣200萬元者，得向農委會申請此獎項，每案核給新台幣8萬元及獎狀乙紙。

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農委會成果管理權責人員貢獻獎：

依據「行政院農業委員會科學技術研究發展成果管理及運用獎助作業要點(106.10.26修正)」，本校專責人員協助執行農委會計畫成果之管理及運用績效卓著者，得向農委會申請參與此獎項之徵選，獲獎者核給新台幣5萬元及獎狀乙紙。

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國家磐石獎

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中小企業創新研究獎

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小巨人獎

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國家品質獎

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台灣精品獎